投标保证金是在招投标过程中的一种常见要求，以确保投标人能够履行合同义务，并提供一定的经济保障。《中华人民共和国政府采购法实施条例》第九十条规定了国务院投标保证金保函的具体内容、申请流程及保额等事项。
国务院投标保证金保函是投标人向政府采购单位提交的一种经济保障工具，其作用主要有以下几个方面：
1. 保证金保函可以证明投标人的财务状况稳定且具备履约能力，增加投标人的信誉度，提高中标的几率；
2. 投标保证金保函可以作为落标后的违约金，确保投标人不会无故放弃合同或者履约不力；
3. 可充当政府采购单位与投标人之间的资金沟通桥梁，确保双方在合同履行过程中的各项支付事宜得到妥善解决；
4. 投标保证金保函可以避免无效投标，减少政府采购单位的时间和精力成本，提高招标工作效率。
根据《中华人民共和国政府采购法实施条例》第九十一条规定，投标人申请国务院投标保证金保函时，需要经过以下步骤：
1. 在递交投标文件的同时，向政府采购单位提出投标保证金保函的申请；
2. 投标人需提供真实、准确的财务资料，包括申请函、企业营业执照、财务报表等；
3. 政府采购单位核实并评估投标人的财务状况，确认其符合保函的申请条件；
4. 议标委员会或评标委员会根据投标人的财务状况和投标金额等因素，确定保证金保函的具体金额和期限。
在申请国务院投标保证金保函时，投标人需要注意以下事项：
1. 申请保函的金额应符合政府采购单位的要求，过高或过低都可能导致申请被驳回；
2. 提供的财务信息必须真实、准确，并且能够证明投标人具备履约能力；
3. 保函的期限必须与合同期限相符，过长或过短都不利于双方的合作；
4. 在保函有效期内，当投标人中标后，应及时按照合同约定转交为履约保函。
国务院投标保证金保函在政府采购过程中起到了重要的作用，它不仅是一种经济保障手段，更是为了维护公平竞争环境、保护中小型企业以及规范招投标行为而设立的制度。投标人在申请保函时要注意相关流程和要求，确保提交的财务资料真实可靠，以增加自身的中标机会。同时，政府采购单位也需严格执行相关程序，公正、透明地进行保函申请和评估工作，保证投标人的合法权益，促进采购市场的健康发展。
