建设工程履约保函作为建筑项目合同中的重要内容，在保障双方权益、推动工程顺利进行方面起着至关重要的作用。然而，在一些特殊情况下，履约保函可能存在违约行为，这就需要对违约金进行合理设置。
首先，建设工程履约保函的违约金应当符合公平原则。违约金的数额应当合理，并且与违约行为的性质和后果相匹配。如果违约行为造成了较大损失，那么违约金应当相应增加。同时，也要考虑到违约方的经济能力，避免给其过大的压力。
其次，违约金的支付方式应当清晰明确。可以采取一次性支付或分期支付的方式，具体根据合同的约定进行安排，并在合同中明确写明。这样可以避免违约方逃避支付违约金的责任。
第三，建设工程履约保函违约金的具体计算方式应当精确明确。常见的计算方式有按日计算、按比例计算、按固定金额计算等。在选择计算方式时，要考虑到实际情况和公平原则，确保违约方的违约行为能够得到应有的惩罚。
第四，建设工程履约保函违约金的计算基准应当确定明确。根据实际合同的约定，可以以工程项目总额、合同金额或违约方应承担损失为基准进行计算。在确定计算基准时，要充分考虑到各方的利益平衡，确保合理公正。
最后，建设工程履约保函违约金的支付时间也需要在合同中明确规定。一般来说，违约金应当在确认违约事实后的一个固定期限内支付。如果违约方拒绝支付，那么可以采取法律手段进行追偿。
综上所述，建设工程履约保函违约金的设置应当合理、公正，并且在合同中明确规定。只有这样才能有效地约束违约行为，保障工程的正常进行。
