投标保函作为一个招投标中常见的财务保证工具，起到了一定的作用。然而，它也存在着一些缺点。首先，投标保函只适用于招标环节，不涵盖合同履行和质量保证等其他方面。在实际项目进行过程中，如果出现合同违约或者质量问题，投标保函无法提供有效的保障。
其次，投标保函更加注重对招标人利益的保护，对于投标人自身权益的保护较为有限。当招标人解除或变更合同时，投标人常常无法得到及时的赔偿或合理的补偿。这使得投标保函对于投标人来说并非完全可靠的财务手段。
第三个缺点是投标保函所需支付的费用较高。投标保函需要投标人去向银行支付一定比例的保函费用，通常是按照投标金额的一定比例收取，这一费用可能增加了企业的成本负担。对于承包商来说，这可能会加大投标的经济压力。
另外一个缺点是投标保函的申请流程繁琐。为了获得投标保函，投标人需要前往银行，并提供一系列的证明文件，如企业资质、近期银行流水等。整个申请过程可能需要耗费大量的时间和精力，给投标人带来了不必要的麻烦。
投标保函也有着一定的局限性，不适用于小型企业。小型企业的经济实力有限，很难满足银行对于投标保函所需的金额和证明材料要求。因此，对于小型企业而言，投标保函并不是一个实际可行的选择。
最后一个缺点是投标保函存在支付风险。在实际操作中，一些不法之徒利用投标保函进行欺诈行为。他们将虚构或夸大的投标项目提交给银行申请保函，然后逃避履约或者恶意拖欠工程款项。这使得一些投标人面临着巨大的经济损失和法律风险。
综上所述，虽然投标保函在财务保证方面有其一定作用，但是它也有相应的缺点。投标保函的适用范围有限，权益保护受限，费用较高，手续繁琐，不适用于小企业，并存在支付风险等问题。因此，在使用投标保函时需要公司谨慎考虑，权衡利弊，选择适合自身实际情况的财务保证方式。
