进度款指的是在工程项目或其他交易中，按照工作/完成进度支付给承包商或卖方的一部分款项。
履约保函是由银行或保险公司出具，并承诺在合同条款履行不到位时，向受益人支付一定金额的担保文件。其作用是确保承包商或卖方能够按时、按质、完整地执行合同。
当进行进度付款时，扣除履约保函是一种常见的做法。这主要是因为：
扣除履约保函可以迫使承包商或卖方严格遵守合同的约定，并按要求完成工作或交付产品。如果发生违反合同的情况，受益人可以通过履约保函获得补偿。
在工程项目中，进度款通常是根据已完成工作的百分比进行支付，以确保资金的安全性和合理性。如果扣除履约保函后的进度款未按期支付，受益人可以通过担保文件来降低风险。
扣除履约保函可以迫使承包商或卖方提供满足要求的产品或服务，并保证其质量。如果出现质量问题，受益人可以通过履约保函索赔，以解决相关争议。
扣除履约保函是为了确保合同的正常履行、控制风险和保证质量等方面考虑的一种措施。这对于双方都有好处，受益人能够获得保障，承包商或卖方也有动力按照约定完成工作。
