投标保函是在招标项目中参与投标的企业需要提供的担保工具之一。它是一种承诺，保证投标企业在中标后能够按照招标文件的要求完成相关的合同，并为合同的履行提供一定的担保。因此，投标保函开给招标代理单位是合法的。
首先，在中国的招投标法规中并没有明确规定投标保函只能开给招标人，而不能开给招标代理人。因此，投标保函开给招标代理单位是合法的。其次，根据《招标投标法》第四十九条的规定，投标人应当向招标人提交投标保证金或者提供其他形式的担保。而在〈招标文件〉的规定中，对于投标保证金的提供并没有对开具单位进行限制，因此投标保函开给招标代理单位是符合这一规定的。再次，投标保函本身就是一种合法的担保工具，它保证了招标人和中标者之间合同履行的担保责任，无论开具单位是招标人还是招标代理人，都不影响其作为一种担保工具的合法性。
但是，需要注意的是，投标保函的开具单位必须是合法的金融机构或保险公司等。投标保函不属于一般意义上的合同，而是一种债权担保方式。因此，如果开具单位不符合法律规定，可能会对担保的有效性产生负面影响，从而导致投标人的投标被招标人认为无效。
总之，投标保函是招标项目中常用的担保工具之一，其开具单位可以是招标人或招标代理人，因此开给招标代理单位也是合法的。但是，投标保函的开具单位必须是合法的金融机构或保险公司等，否则其担保的有效性可能会受到影响。
