商业保函和银行保函都是一些为了保证交易安全而出具的保函，但是两者还是有很大的区别。
首先，商业保函和银行保函的出具主体不同。商业保函一般由商业保险公司出具，而银行保函则由银行出具。商业保险公司出具商业保函会对其投保人进行一系列的资信调查和评估，以此评估被保险人的信用等级和保费等。
其次，商业保函和银行保函的适用范围也有所不同。银行保函主要用于对经济活动中的交易进行保障，如在工程建设、进出口贸易等领域中，需要支付预付款或者担保金的部分，被申请人可以向银行出具保函，保证其能够按照合同履行相关义务。而商业保函则主要用于对商业信用进行保障，如对货款、服务款、租金等债权的支付。
最后，商业保函和银行保函在保障方式上也有区别。银行保函主要是直接支付担保人已履行职责后的赔偿金额，而商业保函则一般采取先行垫付的方式，对于被保险人未能履行相应职责的情况，则要求被保险人返还已垫付的保费与利息等。
总之，商业保函和银行保函区别较大，企业应根据自己所处的行业以及业务情况来选择相应的保函方式，并注重选择有信誉和良好口碑的供应商出具保函，以保证交易的安全和有效性。
