工程保函和银行保函都是一种信用担保工具，用于确保合同当事方之间的交易安全。工程保函通常用于建筑业、工程承包等行业，而银行保函则主要用于商业贸易。
工程保函是指由保证人向受益人发出的，保证在特定条件下为受益人支付一定金额的担保文件。工程保函主要分为履约保函和投标保函两种形式。银行保函是指银行根据委托人的要求，对受益人作出的信用担保承诺。银行保函主要分为付款保函、履约保函和其他各类保函。
工程保函主要保障的是工程合同履约，确保承包商按照合同要求完成工程，并按时支付货款。银行保函则保障的是商业交易，包括订单履约、商品质量、支付延迟等方面。工程保函主要适用于工程建设、房地产开发等行业，银行保函则适用于国际贸易和内外贸易结算。
工程保函的费用较高，一般需要支付保证金，保费根据保函金额的一定比例计算。办理工程保函还需要提供担保人资质证明和相关申请文件。银行保函的费用相对较低，一般只需支付少量手续费，且银行通常会根据对委托人的信用评估来决定是否接受承兑。
工程保函的受益人可以依据保函向保证人索赔，如果保证人无法履行保函义务，受益人可以要求保证金赔付。银行保函的受益人只能在合同履约不成功后，依照保函约定向银行索赔，而无权要求保证金赔偿。
工程保函一般有固定期限，过了有效期后自动解除。银行保函的期限可以根据合同约定灵活设定，并采用书面形式解除。
工程保函存在一定的违约风险，如果保证人无法履行义务，受益人可能需要通过法律诉讼等方式来维权。银行保函由于银行的信誉较高，相对风险较低，多数情况下受益人容易获得赔偿。因此，在选择使用保函时，合同当事方需要结合具体情况进行考量。
