银行保函和预付款保函是贸易合同中经常使用的两种保函方式，两者的主要区别在于保证期限和保证的内容。
保证期限方面，银行保函一般是长期有效的，可持续几年甚至更长时间；而预付款保函则是短期有效的，通常只有几个月的有效期限。由于保函的有效期限不同，如果需要长期合作，可以选择采用银行保函；而如果只需要短期交易，则预付款保函更为适宜。
在保证的内容方面，银行保函是对交易双方的合同内容进行保证，确保在交货或交付货款时按照合同执行；而预付款保函主要是保证买方按照合同的要求预付货款，并确保在约定时间内交付货物。由于保证的内容不同，银行保函需要对双方合同进行全面的审查，而预付款保函则只需要对预付款进行保证。
此外，银行保函和预付款保函在申请和领取方式上也存在差别。银行保函需要申请人提供一些证明文件，如合同、营业执照等，并承诺在保函到期前支付一定的手续费用；预付款保函则相对较简单，只需提供买卖双方的联系方式、预付货款金额等信息即可申请，手续费用也相对较低。
综上所述，银行保函和预付款保函在保证期限、保证的内容、申请和领取方式等方面均存在差别。在选择应用哪种保函方式时，应根据实际需求和具体情况来进行选择，以最大程度地保障合同交易的安全和顺利进行。
