建设工程担保制度是指在建设工程过程中，承包方向业主提供担保的制度。其主要目的是保障业主利益，防止承包方在工程过程中出现问题而无法解决。然而，建设工程担保制度并不是万能的，它也存在一些不包括的方面。
首先，建设工程担保制度不包括自然灾害等非人为因素造成的损失。虽然建设工程承包方通常会在合同中明确其在此方面的责任和义务，但在自然灾害等情况下，承包方无法承担全部损失。
其次，建设工程担保制度不包括业主自身原因造成的损失。比如，业主在工程建设过程中出现的错误决策或者管理不善而造成的损失，不应由承包方承担全部责任。
最后，建设工程担保制度不包括合同内未清晰约定的责任范围。在工程建设合同中，双方对承包方的职责和义务约定应详细明确，以免出现理解上的误差，实际上需要承包方承担的费用和责任应依据合同约定为准。
综上所述，建设工程担保制度虽然能够较好地保护业主利益，但也存在着不包括的一些范围，需要各方在签订合同时协商，明确责任范围，避免因此出现纠纷。
